Tytułowa Sekcja Alfa jest jedną z części CIA. Jej agenci postanawiają zlikwidować popularnego dziennikarza telewizyjnego, który ich zdaniem, nadmiernie interesuje się okolicznościami zamachu na wysokiego oficera marynarki. Zabójstwa dokonać ma młoda, ale wykwalifikowana agentka, która jednak odmawia wykonania zadania.

W niewielkim, oddalonym od cywilizacji gospodarstwie żyje młoda wdowa wraz z dojrzewającą córką Milką. W jego utrzymaniu pomaga im sąsiad - młody i samotny Krystian. Dziewczyna zdaje sobie sprawę, że jej matka interesuje się chłopakiem, lecz mimo to postanawia zdobyć go dla siebie. Wkrótce okazuje się, że Milka jest w ciąży, natomiast Krystian ucieka z wioski. Córka wychodzi za mąż za starego organistę, który wcześniej zabiegał o względy jej rodzicielki.

Akcja filmu rozgrywa się w Trzebiatowie, malutkim miasteczku nad Wisłą, z którego młodzi ludzie uciekają w poszukiwaniu pracy i lepszego życia do wielkich miast. Mieszkańcy w podnieceniu oczekują na powrót z pisemnego egzaminu maturalnego ich ukochanego sierżanta MO, Władysława Lichniaka. Aby miał jak najlepsze warunki do nauki w miasteczku obowiązuje cisza, a także zakaz picia w gospodzie - jeden kieliszek wódki do ciepłego dania i to wszystko.

W 1943 roku przywieziono Zinaidę Worobiową i jej syna Geńka do obozu w Oświęcimiu. Chłopcu wytatuowano numer i wraz z innymi dziećmi umieszczono w specjalnym baraku. Po wyzwoleniu Oświęcimia władze polskie troskliwie i serdecznie zaopiekowały się najmłodszymi, chorymi i wycieńczonymi ofiarami fabryki śmierci. Dzieci w większości nie pamiętały swoich rodziców, dat, miejsc urodzenia, nawet imion. Geńka wraz z innymi dziećmi umieszczono w domu dziecka.

1945 rok, ostatnie dni II Wojny Światowej. W borneńskiej dżungli rozgrywa się psychologiczna walka pomiędzy dwoma żołnierzami wrogich sobie sił: Australijczyka i Japończyka. To historia odwagi, współczucia i siły ludzkiego ducha.